【精华速递】第一届肿瘤遗传咨询专项培训班第二天
2018-01-16
阅读（）
第一届肿瘤遗传咨询专项培训班第二天的课程依旧精彩纷呈，学员们听课的热情也更加高涨。复旦大学肿瘤医院徐烨教授、复旦大学附属妇产科医院张锋教授、中南大学湘雅二医院施小六教授、中山大学孙逸仙纪念医院欧阳能太教授、复旦大学生命科学院田卫东教授、复旦大学生物医学研究院邢清和教授、中山大学孙逸仙纪念医院李晓娟博士以及NGS行业资深科学家陈云弟博士分别为大家带来了精彩授课。
徐烨：消化系统肿瘤的遗传咨询
复旦大学肿瘤医院徐烨教授向学员们讲授了消化系统肿瘤的遗传咨询。徐教授首先和学员们一起回顾了消化系统常见的遗传性肿瘤，并重点介绍了被称为“癌中之王”的胰腺癌。徐教授特别提到了肥胖是胰腺癌非常重要的危险因素。徐教授指出，目前市场上基因检测日趋泛滥，对基因检测结果的解读需十分慎重。在遗传咨询方面，徐教授强调遗传性肿瘤的外科干预要从术式选择、顺应性、患者回诊的可靠性和生活质量等多方面综合考虑，制定最人性化的治疗方案。最后，徐教授通过一例深结直肠癌伴卵巢癌转移的女性患者在合理治疗方案的帮助下顺利生育子女的病例，使学员们感受到在遗传咨询的帮助下，肿瘤患者同样有机会拥有正常的生活，和家人共享天伦之乐。
张锋：基因组拷贝数变异在肿瘤的诊断和遗传咨询中的作用
复旦大学附属妇产科医院张锋教授向学员们讲授了基因组拷贝数变异在肿瘤的诊断和遗传咨询中的作用。张教授向学员们详细介绍了基因拷贝数变异的产生机制、检测方法和相关疾病，并介绍了不同NGS平台的历史和相互关系，使学员们对NGS发展的整体脉络有了清晰的认识。张教授指出，基因拷贝数变异比常规分子检测中备受关注的点突变发生率更高，是基因组进化的重要推动力，而拷贝数变异的致病机理也远较点突变更为复杂，具有明显的缺失（Haploinsufficiency）或获得（Triplosensitivity）剂量效应。在遗传咨询中基因拷贝数变异应受到更多的重视。
施小六：遗传科的历史渊源和工作传承
中南大学湘雅二医院遗传科施小六教授向学员们介绍了国内唯一已开展临床诊断工作的湘雅二医院遗传科的历史渊源和工作传承。施教授指出医学遗传科的定位应该是协助临床开展诊断工作，并应紧密联系检验、病理、影像等多个医技科室，协同工作。在这一模式的帮助下，湘雅二医院在短短的两年内已收治700多例家系，包括近亲结婚家族性噬血性淋巴细胞组织增生症、肠病性肢端皮炎、慢性中性粒细胞白血病伴深静脉形成、黑斑息肉综合征等多种罕见疾病，诊断阳性率达60%。施教授还通过一次湘西近亲结婚家系调查的实例，让学员们感受到了一线遗传咨询工作的艰辛和为患者解除病痛后的喜悦。
欧阳能太：NGS的临床应用
中山大学孙逸仙纪念医院细胞分子诊断中心欧阳能太教授讲授了NGS的临床应用。欧阳教授首先用飞机与自行车的例子向学员们形象地解释了PCR、毛细管测序和NGS等不同基因检测技术之间的差异和适用范围。在随后的授课中，欧阳教授从最基本的DNA结构开始向学员们讲授了DNA骨架中戊糖的排列方式及对DNA测序的影响；焦磷酸（PPi）的产生和在NGS中的应用；H离子测序在NGS中的优势。在样品制备方面，欧阳教授指出病理是沟通肿瘤分子检测与临床诊断的桥梁，在肿瘤分子检测中瘤内空间异质性（Intratumoural SpatialHeterogeneity）对肿瘤体细胞突变检测具有非常重要的影响。NGS在基因检测中具有高通量的优势，但应慎重选择。对于一些常见突变的验证工作，传统的毛细管测序足以解决问题。最后，欧阳教授还给大家介绍了室间质评相关内容。
田卫东：肿瘤遗传咨询的生物信息学工作流
复旦大学生命科学院田卫东教授讲授了肿瘤遗传咨询的生物信息学工作流。生物信息解读是NGS中最为复杂的内容，也是肿瘤NGS分析结果差异的最重要原因。田教授重点介绍了NGS测序的原始数据格式、测序数据的质量评估方法和测序数据的生物信息学分析工作流，为众多临床工作者揭开了生信分析的神秘面纱，使学员们对测序数据的产生、质控和基本分析原理有了一个直观的认识。在介绍了生物信息基础知识后，田教授又进一步介绍了常用的生物信息分析软件和权威的数据库。
邢清和：乳腺癌的遗传风险分析及遗传咨询
复旦大学生物医学研究院邢清和教授讲授了乳腺癌的遗传风险分析及遗传咨询。邢教授详细介绍了BRCA1和BRCA2两个基因的位置、结构和功能，对BRCA基因的研究历史也做了简要的回顾。为了使学员深入理解遗传风险评估，邢教授对遗传风险相关的两个基本概念——外显率（Penetrance）和表现度（Expressivity）进行了深入的解读，帮助学员了解其中一个是“质”的概念，一个是“量”的概念。在乳腺癌基因检测结果中，邢教授重点介绍了ACMG指南中致病变异和良性变异的分类标准，同时对家族史、初产年龄和突变位点等因素对发病的影响也做了介绍。
李晓娟：NGS数据解读的临床应用及遗传咨询
中山大学孙逸仙纪念医院细胞分子诊断中心李晓娟博士讲授了NGS数据解读的临床应用及遗传咨询。李博士从数据分析的临床验证标准和指南、数据解读的基本流程和遗传咨询三个方面介绍了NGS在遗传咨询中的应用。李博士还详细介绍了HGVS系统命名法，以IGV为例介绍了变异位点的分析，并对NGS数据质控进行了补充说明。李博士的介绍使学员们进一步明确了NGS数据的分析和解读是肿瘤遗传咨询的基础。
陈云弟：NGS在液态活检方面的最近进展
NGS行业资深科学家陈云弟博士向大家介绍了NGS在液态活检方面的最近进展。陈博士首先通过最基础的琼脂糖凝胶电泳帮助大家认识到核小体在DNA片段化中的作用，既帮助学员理解了血浆游离DNA产生的机制和特征，又帮助学员掌握了发生细胞凋亡的DNA模板的正确处理方式。随后，陈博士介绍了液态活检的临床应用范围和优势，并将自己多年的经验传授给学员，使学员了解到血浆游离DNA检测和肿瘤样品不同，可直接用外周血有核细胞作对照。在采样环节，陈博士根据自身多年的经验教训，反复强调样品一定不能发生凝血。陈博士还向学员们展示了自己工作中一些高质量的NGS测序数据，令学员们对液态活检有了全新的认识。
培训圆满结束
在两天的培训中，学员们系统学习了肿瘤遗传学基础、肿瘤靶向治疗进展、NGS数据分析和遗传伦理等众多肿瘤遗传咨询相关内容，享用了一场丰盛的学术盛宴，收获颇丰。培训结束后，学员们进行了结业考试，大家均悉心对待考试，认真答题，努力交出一份另自己满意的答卷。
通过本次肿瘤遗传咨询专项培训，中国遗传学会遗传咨询分会与中山大学孙逸仙纪念医院建立了良好的合作，进一步传授和推广了遗传咨询知识，培养了一大批肿瘤遗传咨询专业人员，为我国遗传咨询事业又做了一件扎实的工作。接下来，中国遗传学会遗传咨询分会将继续坚持专业性、权威性和公益性的原则，不忘初心，砥砺前行，为我国遗传咨询事业的发展做出更大的贡献。
徐烨：消化系统肿瘤的遗传咨询
复旦大学肿瘤医院徐烨教授向学员们讲授了消化系统肿瘤的遗传咨询。徐教授首先和学员们一起回顾了消化系统常见的遗传性肿瘤，并重点介绍了被称为“癌中之王”的胰腺癌。徐教授特别提到了肥胖是胰腺癌非常重要的危险因素。徐教授指出，目前市场上基因检测日趋泛滥，对基因检测结果的解读需十分慎重。在遗传咨询方面，徐教授强调遗传性肿瘤的外科干预要从术式选择、顺应性、患者回诊的可靠性和生活质量等多方面综合考虑，制定最人性化的治疗方案。最后，徐教授通过一例深结直肠癌伴卵巢癌转移的女性患者在合理治疗方案的帮助下顺利生育子女的病例，使学员们感受到在遗传咨询的帮助下，肿瘤患者同样有机会拥有正常的生活，和家人共享天伦之乐。
张锋：基因组拷贝数变异在肿瘤的诊断和遗传咨询中的作用
复旦大学附属妇产科医院张锋教授向学员们讲授了基因组拷贝数变异在肿瘤的诊断和遗传咨询中的作用。张教授向学员们详细介绍了基因拷贝数变异的产生机制、检测方法和相关疾病，并介绍了不同NGS平台的历史和相互关系，使学员们对NGS发展的整体脉络有了清晰的认识。张教授指出，基因拷贝数变异比常规分子检测中备受关注的点突变发生率更高，是基因组进化的重要推动力，而拷贝数变异的致病机理也远较点突变更为复杂，具有明显的缺失（Haploinsufficiency）或获得（Triplosensitivity）剂量效应。在遗传咨询中基因拷贝数变异应受到更多的重视。
施小六：遗传科的历史渊源和工作传承
中南大学湘雅二医院遗传科施小六教授向学员们介绍了国内唯一已开展临床诊断工作的湘雅二医院遗传科的历史渊源和工作传承。施教授指出医学遗传科的定位应该是协助临床开展诊断工作，并应紧密联系检验、病理、影像等多个医技科室，协同工作。在这一模式的帮助下，湘雅二医院在短短的两年内已收治700多例家系，包括近亲结婚家族性噬血性淋巴细胞组织增生症、肠病性肢端皮炎、慢性中性粒细胞白血病伴深静脉形成、黑斑息肉综合征等多种罕见疾病，诊断阳性率达60%。施教授还通过一次湘西近亲结婚家系调查的实例，让学员们感受到了一线遗传咨询工作的艰辛和为患者解除病痛后的喜悦。
欧阳能太：NGS的临床应用
中山大学孙逸仙纪念医院细胞分子诊断中心欧阳能太教授讲授了NGS的临床应用。欧阳教授首先用飞机与自行车的例子向学员们形象地解释了PCR、毛细管测序和NGS等不同基因检测技术之间的差异和适用范围。在随后的授课中，欧阳教授从最基本的DNA结构开始向学员们讲授了DNA骨架中戊糖的排列方式及对DNA测序的影响；焦磷酸（PPi）的产生和在NGS中的应用；H离子测序在NGS中的优势。在样品制备方面，欧阳教授指出病理是沟通肿瘤分子检测与临床诊断的桥梁，在肿瘤分子检测中瘤内空间异质性（Intratumoural SpatialHeterogeneity）对肿瘤体细胞突变检测具有非常重要的影响。NGS在基因检测中具有高通量的优势，但应慎重选择。对于一些常见突变的验证工作，传统的毛细管测序足以解决问题。最后，欧阳教授还给大家介绍了室间质评相关内容。
田卫东：肿瘤遗传咨询的生物信息学工作流
复旦大学生命科学院田卫东教授讲授了肿瘤遗传咨询的生物信息学工作流。生物信息解读是NGS中最为复杂的内容，也是肿瘤NGS分析结果差异的最重要原因。田教授重点介绍了NGS测序的原始数据格式、测序数据的质量评估方法和测序数据的生物信息学分析工作流，为众多临床工作者揭开了生信分析的神秘面纱，使学员们对测序数据的产生、质控和基本分析原理有了一个直观的认识。在介绍了生物信息基础知识后，田教授又进一步介绍了常用的生物信息分析软件和权威的数据库。
邢清和：乳腺癌的遗传风险分析及遗传咨询
复旦大学生物医学研究院邢清和教授讲授了乳腺癌的遗传风险分析及遗传咨询。邢教授详细介绍了BRCA1和BRCA2两个基因的位置、结构和功能，对BRCA基因的研究历史也做了简要的回顾。为了使学员深入理解遗传风险评估，邢教授对遗传风险相关的两个基本概念——外显率（Penetrance）和表现度（Expressivity）进行了深入的解读，帮助学员了解其中一个是“质”的概念，一个是“量”的概念。在乳腺癌基因检测结果中，邢教授重点介绍了ACMG指南中致病变异和良性变异的分类标准，同时对家族史、初产年龄和突变位点等因素对发病的影响也做了介绍。
李晓娟：NGS数据解读的临床应用及遗传咨询
中山大学孙逸仙纪念医院细胞分子诊断中心李晓娟博士讲授了NGS数据解读的临床应用及遗传咨询。李博士从数据分析的临床验证标准和指南、数据解读的基本流程和遗传咨询三个方面介绍了NGS在遗传咨询中的应用。李博士还详细介绍了HGVS系统命名法，以IGV为例介绍了变异位点的分析，并对NGS数据质控进行了补充说明。李博士的介绍使学员们进一步明确了NGS数据的分析和解读是肿瘤遗传咨询的基础。
陈云弟：NGS在液态活检方面的最近进展
NGS行业资深科学家陈云弟博士向大家介绍了NGS在液态活检方面的最近进展。陈博士首先通过最基础的琼脂糖凝胶电泳帮助大家认识到核小体在DNA片段化中的作用，既帮助学员理解了血浆游离DNA产生的机制和特征，又帮助学员掌握了发生细胞凋亡的DNA模板的正确处理方式。随后，陈博士介绍了液态活检的临床应用范围和优势，并将自己多年的经验传授给学员，使学员了解到血浆游离DNA检测和肿瘤样品不同，可直接用外周血有核细胞作对照。在采样环节，陈博士根据自身多年的经验教训，反复强调样品一定不能发生凝血。陈博士还向学员们展示了自己工作中一些高质量的NGS测序数据，令学员们对液态活检有了全新的认识。
培训圆满结束
在两天的培训中，学员们系统学习了肿瘤遗传学基础、肿瘤靶向治疗进展、NGS数据分析和遗传伦理等众多肿瘤遗传咨询相关内容，享用了一场丰盛的学术盛宴，收获颇丰。培训结束后，学员们进行了结业考试，大家均悉心对待考试，认真答题，努力交出一份另自己满意的答卷。
通过本次肿瘤遗传咨询专项培训，中国遗传学会遗传咨询分会与中山大学孙逸仙纪念医院建立了良好的合作，进一步传授和推广了遗传咨询知识，培养了一大批肿瘤遗传咨询专业人员，为我国遗传咨询事业又做了一件扎实的工作。接下来，中国遗传学会遗传咨询分会将继续坚持专业性、权威性和公益性的原则，不忘初心，砥砺前行，为我国遗传咨询事业的发展做出更大的贡献。
推荐书籍
