【精华速递】第一届遗传咨询高级班精彩瞬间
2017年9月18日-30日,中国遗传学会遗传咨询分会第一届遗传咨询高级班在波士顿隆重召开。期间,哈佛医学院波士顿儿童医院遗传及基因组部大系主任Christopher Walsh教授、遗传临床科主任Olaf Bodamer教授、哈佛医学院波士顿儿童医院副院长/国际健康服务执行主席/OPENpediatrics创始人Jeffrey Burns教授、哈佛-麻省理工大学Broad研究所临床研究测序平台医学负责人/ClinGen创始人Heidi L. Rehm教授、哈佛医学院Brigham妇女医院/美国人类遗传协会主席Cynthia Casson Morton教授、波士顿儿童医院罕见病研究中心Alan H. Beggs教授、美国波士顿儿童医院遗传部临床遗传学家Joan Marilyn Stoler教授、麻省总医院儿科遗传的资深医学遗传学家/美国医学遗传学杂志的副主编Angela E. Lin教授等多位国际知名的临床遗传学专家给学员们带来了精彩授课。
Olaf Bodamer:关于“精准医学”的报告
哈佛医学院波士顿儿童医院遗传临床科主任Olaf Bodamer教授首先介绍了精准医学概念以及最新进展,并指出基因组学研究和创新网络:需要依赖政府、科学家、数据库、技术。接着,Olaf Bodamer教授介绍了精准医学的应用,包括临床表型、软件工具、计算机辅助图形分析、精准治疗、高通量药物筛选和数据库建设。最后,Olaf Bodamer教授指出,精准医学时代是资源和信息的时代,掌握并整合应用好遗传资源,具有高效的学习能力和信息收集应用能力尤为重要。
Monkol Lek:关于“二代测序在罕见病诊断中的应用”的报告
Broad研究所及麻省总院的Monkol Lek教授首先带领学员们回顾了遗传学的中心法则,并分别讲解了一代测序和二代测序的基本原理。紧接着,Lek教授介绍了外显子测序、全基因组测序以及RNA测序,并指出当外显子组测序没有结果时,我们认可采用病例/对照分析、RNA 测序或全基因组测序。最后,Lek教授详细介绍了关于Genotype and Expression (GTEx) 项目的使用信息,并指出通过这些二代测序技术,罕见病诊断的天平正在逐渐向有利的一面倾斜。
Laura Chadwick:关于“临床药物基因组学”的报告
波士顿儿童医院的药学博士/临床药学专家Laura Chadwick 教授首先介绍了药物基因组学的研究内容、基因改变、药物(代谢)动力学、药效学、免疫应答效应的定义,以及药物基因组学的目标及益处。接着,Chadwick教授以可待因、帕罗西丁、磷苯妥英、苯妥英钠、硫代嘌呤甲基转移酶、硫唑嘌呤、卡马西平为例介绍了药物基因组学的临床实践。最后,Chadwick教授介绍了药物基因组学面临的挑战,主要表现在保险覆盖范围、教育培训、与临床试验的合作、意外结果的处理、异常药物基因相关的发现、基于循证医学制定指南的发展、测试方案优先执行、基金的支持以及非遗传因素的影响等。
Joan Marilyn Stoler:关于“临床遗传学中畸形学”的报告
美国波士顿儿童医院遗传部临床遗传学家Joan Marilyn Stoler教授首先指出,出生缺陷的类型包括畸形、发育受阻、变形、发育不良几方面,并重点阐述了几种缺陷类型的临床定义,阐明了临床中常见的综合征、序列症、复合征、联合征的定义与区别。接着,Stoler教授强调了畸形评估过程中一些值得注意的方面。最后,Stoler教授着重讲解了疾病的信息采集、致病解析、产前诊断,后续治疗、随访等方面的内容,指出遗传咨询师的角色举足轻重,是各个学科连接的桥梁和纽带。
Angela E. Lin:关于“常见遗传病”的报告
麻省总医院儿科遗传的资深医学遗传学家/美国医学遗传学杂志的副主编Angela E. Lin教授首先介绍了各类遗传资源,并对这些工具的特点进行了介绍。接着,Lin教授还对各类遗传综合征的分类及模式进行了归纳总结,并引出最常见的10大类综合征,包括染色体异常类综合征(三体、性染色体及缺失)、联合征(VATER/VACTERL)、序列征(关节挛缩症,多关节挛缩症,先天性多关节挛缩症)等。最后,Lin教授从每类综合征的病因、诊断标准、表型、检查、相关基因及突变等方面进行了详细的讲解。
Kathryn Gray:关于“基因组学如何变革产前遗传检测”的报告
Brigham& Women's Hospital母胎医学部的Kathryn Gray医生首先介绍了携带者筛查的目的、时间、疾病种类、人群以及所面临的问题。接着,Kathryn Gray医生介绍了产前筛查方法的比较。最后,Kathryn Gray医生讲解了产前诊断的临床应用指征和常用的产前诊断方法,包括核型分析、FISH、染色体微阵列分析(CMA,俗称基因芯片)及其他分子DNA检测技术。
Harvey L. Levy:关于“新生儿筛查在遗传病早期精准诊断与治疗中的作用”的报告
哈佛医学院儿科学教授/波士顿儿童医院基因及基因组学部的资深医学遗传学医师Harvey L. Levy教授首先回顾了新生儿疾病的起源及进展。接着, Levy教授详细叙述了多种传统筛查病种的临床表型、代谢途径、治疗方案。之后,Levy教授肯定了新生儿疾病筛查是预防医学的重大进步,并指出仍存在许多待解决的问题及面临的挑战。最后,Levy教授重点介绍了NGS的技术进展、新生儿疾病筛查中的发展前景以及BabySeq计划在美国的开展情况。
Gerard Berry:关于“精准医学中的先天性代谢缺陷病”的报告
哈佛医学院儿科教授/波士顿儿童医院代谢项目的主任和在代谢方面的主席Berry教授首先对遗传病进行了一个分类的概述,对代谢病来说,可分为小分子病和贮积病,按照涉及的细胞器来说,可分为溶酶体病、线粒体病和过氧化物病。接着,Berry教授讲解了新生儿筛查和使用的串联质谱技术以及遗传代谢病的常见临床表现,Berry教授侧重讲解了四大先天性代谢缺陷。最后,Berry教授总结了每种先天性代谢缺陷病的致病机制以及临床治疗和管理。
Sharyn Lincoln:关于“美国遗传咨询师的介绍”的报告
波士顿儿童医院的注册遗传咨询师Sharyn Lincoln女士首先讲解了遗传咨询师的定义,遗传咨询师不同于临床医师,遗传咨询专业人员是指经过遗传学和遗传咨询专门培训,为病人提供关于他们家族或其子女遗传健康的个体化咨询服务的人员,已成为临床、实验室和科研的桥梁。接着,Lincoln女士介绍了遗传咨询的工作场所,包括产前、儿科、神经科、心血管科、肿瘤等遗传门诊。最后,Lincoln女士指出,在基因组学和基因检测技术飞速发展的今天,遗传咨询显得越来越重要,而遗传咨询师能够起到的作用也越来越重要,遗传咨询培训更是越来越紧迫。
Gretchen Schneider:关于“遗传咨询项目在美国开展的情况”的报告
Brandeis大学遗传咨询项目的主任Gretchen Schneider教授首先介绍了美国遗传咨询机构的组成、遗传咨询师在美国的分布情况、遗传咨询师在美国的构成、遗传咨询师在多个专业领域开展咨询,临床遗传咨询师咨询内容包括癌症、产前诊断、儿科、一般的遗传病和心血管疾病等。接着,Schneider教授指出非临床遗传咨询师以从事非学术的-商业实验室诊断最多占49%,在大学医疗中心占14%。最后,Schneider教授还介绍了遗传咨询师培训计划的历史、当前在北美的培训计划和主要内容以及Brandeis大学遗传咨询项目的入选条件、培训时间和主要内容。
Lance H. Rodan:关于“Undiagnosed Disease Network”的报告
哈佛大学Lance H. Rodan教授首先介绍了UND项目的背景和项目组成成员。接着,Rodan教授介绍了Harvard大学参加UND项目的成员和近期研究成果,并且在会上分享了4个病例。之后,Rodan教授介绍了临床病例和血液样本的采集和处理方式、临床的评估过程,遗传检测、数据分析和临床随访,以及科研合作等。最后,Rodan教授指出,UDN项目的启动,可以为疑难病例进行个体化量身定制研究方案,真正实现个体的精准医学目的。
Christina Jacobsen:关于“骨发育异常疾病”的报告
波士顿儿童医院内分泌科骨骼健康研究项目主任Christina Jacobsen教授首先从临床着手,告诉我们临床在遇到什么情况时需要考虑骨发育异常,指出临床上体型不匀称性矮小、频繁无创伤性骨折、关节疼痛、有家族史等情况,需要考虑骨骼发育异常。随后,Jacobsen教授还介绍了儿童骨发育异常的术语及命名,并介绍了一些典型及少见的骨骼发育异常疾病。
Christopher Walsh:关于“体细胞嵌合变异与人类疾病”的报告
美国哈佛大学医学院波士顿儿童医院遗传及基因组部主管Christopher Walsh教授首先介绍了体细胞嵌合产生的原因及其特点。接着,Walsh教授从3个层面讲解了致病性体细胞嵌合突变所导致的遗传学效应。随后,Walsh教授列举了几例由于体细胞嵌合突变而导致的严重的遗传病和致病基因的研究。最后,Walsh教授提出问题:除了脑部疾病以外,还有哪些疾病可以是体细胞嵌合突变导致?引导学员进行思考。
Amy Kritzer:关于“质量改进的问题”的报告
波士顿儿童医院遗传和基因组学部Amy Kritzer教授首先介绍了质量改进的概念、5大原则、质量改进的模式。接着,Kritzer教授介绍了SMART目标,即Specific-具体的、Measurable-可测量的、Actionable-可行的、Realistic-真实的、Time Bound-有时限的的目标确定和实施过程中以PDSA(Plan-计划、Do-规定、Study-研究、Act-行动)循环不断改进。最后,Kritzer教授介绍了质量改进的常见项目,并以急性呼吸困难和PKU为例对此类项目进行了解读以及对质量改进的相关资源进行了介绍。
Joan Stoler:关于“哈佛遗传学培训项目介绍”的报告
波士顿儿童医院临床遗传专科医生Joan Stoler博士首先介绍了在临床遗传及相关教育、执业领域的一些概念。接着,Stoler博士介绍了哈佛医学院医学遗传学培训项目的具体内容,包括入学资质、培训项目分类和培养目标。最后,Stoler博士指出,哈佛医学院医学遗传学培训项目是美国最大的遗传学培训项目之一,该项目一直致力于培养未来医学遗传学领域内的领袖。
Nina Gold:关于“哈佛医学院医学遗传学培训项目参加者的经历分享”的报告
波士顿儿童医院的儿科Nina Gold 医生首先分享了自己从Colby College毕业后考入哈佛医学院,经历4年的医学院学习后,又进入4年的儿科/遗传学联合培养项目的经历。接着,Nina Gold 医生分享了自己在儿科/遗传学联合培养项目的体会。最后,Nina Gold 医生介绍了自己的研究方向,并介绍了自己在生物化学、分子遗传学以及临床遗传学方向的研究成果。
Jeffrey Burns:关于“OPENpediatrics应用系统”的报告
哈佛医学院波士顿儿童医院副院长、国际健康服务执行主席Burns教授首先对OPENpediatrics进行了概述,并阐述了OPENpediatrics的设计初衷和理念。接着,Burns教授介绍了OPENpediatrics的运行及应用,指出通过OPENpediatrics可以分享175万项资源。之后,Burns教授介绍了OPENpediatrics的特点和创新,如个性化的学习方式、愉快互动的学习测试系统、友好的界面和巨大的储备。最后,Burns教授介绍了后续发展计划:学习和决策支持相结合,植入人工智能以辅助决策。
Alan H. Beggs:关于“Babyseq Project”的报告
波士顿儿童医院罕见病研究中心的Alan H. Beggs教授首先从早期经典的新生儿PKU筛查入手,引出2012年ACMG指南,并进一步逐一阐述了基因检测用于新生儿筛查的利与弊。接着,Beggs教授指出,该项目致力于将基因组测序数据应用于儿童期风险预测及新生儿疾病评估,并对失访数据的原因进行了分析比较。之后,Beggs教授介绍了项目最新结果以及所受的伦理争议。最后,Beggs教授指出,在健康人群中应用WES作为筛查工具,对携带者检测有一定功用,且一定程度上有利于家庭规划。
Heidi L. Rehm:关于“基因变异临床解读”的报告
哈佛-麻省理工大学Broad研究所临床研究测序平台医学负责人Heidi L. Rehm教授首先介绍了用于评估基因变异的临床相关性的权威数据资源库Clin Gen的整体情况。接着,Rehm教授指出,ClinGen将组织一个工作小组,专门用标准程序来评估这些基因、变异、遗传和表型。新数据库被称为Clin GenKB,让专家们能管理基因变异,并统一解读。最后,Rehm教授提出Clin Gen将提供可靠的资源,为遗传变异找到临床解释。
Catherine Brownstein:关于“儿科领导力奖”的报告
哈佛大学波士顿儿童医院遗传与基因组中心助理研究员Catherine Brownstein教授详细介绍了由波士顿儿童医院组织设立的“儿科领导力奖”,设立该奖项的主要目的是为了促进遗传检测的临床应用发展以及基因组学的信息传播,基本过程是:由某一个机构提供病材,包括病例和样本,世界范围内各相关单位均可申请参加,然后根据完成时间、检测和分析方法以及结果等评比,选出获奖优胜者。该奖项是基因测序和数据解释的最佳实践,对我国基因行业具有重要启示。
沈亦平:关于“遗传检测的管理监控”的报告
美国哈佛医学院波士顿儿童医院遗传学及基因组学部、遗传学培训部主任沈亦平教授首先阐述了对遗传检测进行管理监控的必要性,以及管理监控的目的。接着,沈教授阐述了临床实验室的概念、遗传检测的分类和CLIA对检测实验室质量监控的一系列措施,包括能力验证和报告制度、实验管理措施(分析前、分析中、分析后)、质量控制和改进措施、人员资质、培训和能力评估。最后,沈教授阐述了临床遗传医生的基本任务,包括预防、临床及分子诊断、疾病风险/病程预测、治疗等。
Cynthia Casson Morton:关于“临床细胞遗传学的测序时代:我们需要单核苷酸水平的精准度”的报告
哈佛医学院Brigham妇女医院的Cynthia Casson Morton教授首先回顾了临床细胞遗传学发展历程:从染色体核型分析、历经FISH、染色体微阵列分析、到目前的二代测序。接着,Morton教授重点介绍了Developmental Genome Anatomy project(DGAP),即先天性异常的患者中出现的染色体重排可能是通过对人类发育关键基因的破坏或失调而引起异常表型的致病原因。之后,Morton教授分享了应用产前二代细胞遗传学技术对10例高风险病例进行检测的结果。最后,Morton教授强调了评估基因断点处被破坏或潜在失调需要核苷酸水平的精度。
附现场花絮: